Airpods

フレッド・ハッチのリーダーたちが、新薬発見の促進を目指すAIスタートアップに1000万ドルを調達

フレッド・ハッチのリーダーたちが、新薬発見の促進を目指すAIスタートアップに1000万ドルを調達
Synthesize Bioの共同創設者であり、フレッド・ハッチンソンがんセンターの研究者であるジェフ・リーク氏（左）とロバート・ブラッドリー氏。（LinkedInの写真）

フレッド・ハッチンソンがんセンターのリーダーらが設立したシアトルを拠点とするスタートアップ企業 Synthesize Bio は、マドロナ・ベンチャー・グループから 1,000 万ドルの資金提供を受けたと発表した。

このバイオテクノロジー企業は、人工知能を用いて仮想的な実験結果をシミュレーションすることで、新薬の発見をより迅速かつ安価にすることを目指しています。研究チームは、遺伝子発現を予測し、新薬が細胞の挙動にどのような影響を与えると予想されるかについての知見を提供する、生成ゲノミクス基盤モデル（GEM-1）を構築しました。

火曜日、Synthesize Bioの研究者らは、このモデルとその性能を説明するプレプリントをbioRxivに公開した。科学者らによると、このモデルは「将来の遺伝子発現実験結果を実験室レベルの精度で予測する」ものだった。

Synthesize Bio は 16 人のチームで構成され、約 2 年前に Fred Hutch の最高データ責任者 Jeff Leek 氏と Fred Hutch のトランスレーショナル データ サイエンス統合研究センター所長 Robert Bradley 氏によって共同設立されました。

研究チームは、研究実験とRNAシーケンシングデータ（細胞内で発現している遺伝子を捉えるデータ）を関連付けた公開情報を用いてモデルを学習させた。データセットには、実験室研究や臨床試験で分析された健康なヒト細胞と病変組織、および病的なヒト細胞と組織が含まれていた。

「これは、ライフサイエンスの研究開発における可能性を再定義するようなインフラの変革です」と、マドロナのマネージングディレクター、マット・マキルウェイン氏はLinkedInで述べています。「生成ゲノミクスによって、研究者はより大胆な問いを立て、よりスマートな試験を設計し、これまでは費用がかさんだり、検討不可能だった仮説を検証できるようになります。」

Synthesize Bio テクノロジーの仕組みを示す図。(Synthesize Bio)

Synthesize Bioチームはプレプリント論文の中で、解決しようとしている問題について詳しく説明しました。「多くの実験室実験は、細胞の増殖や疾患の発症速度を超える速度で実施することはできません」と同社は記しています。「一方、臨床試験も同様に、参加者の確保と募集、そして患者保護のための必須規制によって規制されています。」

AIモデルの生成能力は、「多くの、あるいはすべての制限的な実験ステップを計算的にシミュレートすることで、こうした基本的な生物学的制約を回避する可能性を提供する」と研究者らは続けた。

この技術は研究プロセス中に漸進的なフィードバックを提供することもできるため、科学者をより有望な解決策に導くことができます。

例えば、Synthesize Bio は、臨床安全性試験に合格した候補薬を持つ研究者が、それらの治療法が意味のある健康効果をもたらす可能性があるかどうかを評価するのに役立つ可能性があります。

「生物学者は、基礎科学に携わっているか、臨床試験を通じて新薬の開発を進めている企業で働いているかに関わらず、常に重要な決断を下さなければならない立場にあります」とブラッドリー氏はGeekWireに語った。「そして、十分な情報がないまま、非常にコストのかかる決断を下すことも少なくありません。」

誰でも利用できるようになったこの技術は、トランプ政権が政府支出削減を目指し、研究助成金などの資金を削減しようとしている厳しい時期に登場した。リーク氏とブラッドリー氏は、基礎研究への支援は依然として不可欠であると強調した。

「私たちのビジョンは、誰かが私たちのモデルを使い始めて、今やっているのと全く同じ仕事を、より少ない費用でできるようになることではありません」とブラッドリー氏は述べた。「私たちのビジョンは、誰かが私たちのAIモデルを使い始めて、今よりも10倍の科学研究を行い、10倍の発見をできるようになることです。」

マキルウェイン氏は、チームの慎重なアプローチと技術​​の厳格なテストを称賛した。

「この二人は健全な懐疑論者だ」と彼はGeekWireに語った。「彼らは現実的で地に足のついた人たちで、『証明してくれ、見せてくれ』という感じだ」

Synthesize Bio は、シアトル地域で AI を活用したシステムを開発している数多くのバイオテクノロジーの新興企業や研究グループに加わります。

  • ワシントン大学のタンパク質設計研究所 (IPD) は、AI を利用して、さまざまな病気の治療に使用できる新しいタンパク質を構築しています。
  • フレッド・ハッチが率いる Cancer AI Alliance は、ダナ・ファーバー、メモリアル・スローン・ケタリング、ジョンズ・ホプキンスも参加するコンソーシアムで、アレン AI 研究所 (Ai2) と Google Cloud の支援を受けています。
  • アレン研究所のシアトル合成生物学ハブでは、DNA ベースの技術を使用して、時間の経過とともに細胞が経験する変化を記録しています。
  • Xaira Therapeutics、Archon Biosciences、Lila Biologics、Outpace Bio、A-Alpha Bio、Talus Biosciences、Potatoなど、数多くのスタートアップ企業を輩出しています。IPDだけでも10社のスタートアップ企業をスピンオフさせています。

「生成ゲノミクスは将来の実験結果を正確に予測する」と題されたプレプリントの他の著者は、Gregory Koytiger、Alice M. Walsh、Vaishali Marar、Kayla A. Johnson、Max Highsmith、Alexander R. Abbas、Andrew Stirn、Ariel R. Brumbaugh、Alex David、Darren Hui、Jeffrey M. Kahn、Sheng-Yong Niu、Liza J. Ray、Candace Savonen、Stein Setvikです。

編集者注：記事は9月17日に更新され、Synthesize Bioの共同設立者兼投資家であるMatt McIlwain氏のコメントが追加されました。