遺伝子解析により、コロナウイルス感染は6日ごとに倍増し、数百人に広がっていることが示唆されている

アラン・ボイル著2020年3月2日午後6時26分2020年5月28日午後5時53分

5月28日午後5時50分（太平洋標準時）の更新：最新の分析では、米国でのコロナウイルス発生の起源について異なるシナリオが提案されています。

シアトル地域の患者から採取されたCOVID-19コロナウイルスサンプルのゲノム配列に基づく進化分析によると、感染者数はおよそ6日ごとに倍増しており、過去6週間で数百人の感染者が発生したことになる。

ワシントン州西部ではこれまでに18人の感染が確認されており、キング郡で14人、シアトル北部のスノホミッシュ郡で4人となっています。本日時点で、5人の患者が死亡しており、うち4人はキング郡、1人はスノホミッシュ郡で死亡しています。

しかし、シアトルのフレッド・ハッチンソンがん研究センターでウイルス動態を専門とする研究者、トレバー・ベッドフォード氏が一連のツイートで示した分析によると、米国で最初にウイルスと診断された患者から続く感染連鎖には、さらに多くの人々が関与している可能性が高いと結論づけている。感染に気づかずにウイルスを広めた人もいた可能性があり、これは「潜在的感染」と呼ばれる現象である。

コンピューターモデルをどのように調整するかによって、1月中旬に中国の都市武漢からスノホミッシュ郡に旅行したWA1として知られる患者から始まった感染連鎖を通じて、最大1,500人がウイルスに感染した可能性がある。

「州全体で感染者が増えるだろう」とベッドフォード氏は綴った。彼は、シアトル地域の現在の新型コロナウイルス情勢は、感染拡大が加速し始めた1月1日頃の武漢の状況に似ているのではないかと懸念していると述べた。「3週間後、武漢では数千人の感染者が出ており、大規模な封鎖措置が取られました」と、ベッドフォード氏は本日、自身のツイートを補足するブログ記事に記した。

ベッドフォード氏の結論は、WA1 と WA2 として知られる別のスノホミッシュ郡の患者のウイルスゲノム配列の綿密な比較に基づいており、ウイルスのより広範な進化樹のどこに当てはまるかの評価につながっています。

2 つの配列は類似していますが、遺伝コードの変異パターンから、伝達の過程でそのコードがどの程度変化したかがわかります。

WA1のウイルスは1月19日に、WA2のウイルスは2月28日に採取されました。これらのウイルスの遺伝子コードは、シアトルインフルエンザ研究を主導した研究チームによって配列決定され、病原性ウイルスに関する世界的なGISAIDデータベースに公開されました。これにより、ベッドフォードは6週間にわたるコロナウイルスの進化系統樹の広がりを再構築することができました。

本日のツイートストームで、ベッドフォード氏はWA1の症例がWA2につながる感染連鎖の始まりだったようだと述べた。「これは、WA1の症例が、軽症のため監視対象から漏れていた人に感染させ、1月中旬のこの時点で感染連鎖が始まったことを示唆している」と同氏は綴った。

WA2を経由した感染経路は検出されなかったが、これはおそらく、先週まで検査活動が中国から直接渡航してきた患者や、既知の感染者と直接接触した患者に集中していたためだと考えられる。

「この検査不足は重大な過ちであり、スノホミッシュ郡とその周辺地域での感染拡大が、検知される前に大きな問題にまで拡大してしまった」とベッドフォード氏は本日のブログ投稿に記した。

ベッドフォード氏は、疾病モデル研究所の疫学者マイク・ファミュラーレ氏と共同で行った分析はまだ予備段階であることを強調した。分析に関する詳細情報を得るために、フレッド・ハッチ氏に連絡を取った。

予備的な結論では、ウイルスの拡散を抑えるための対策、つまり頻繁に手を洗うこと、顔に触れないようにすること、病気の場合は家にいること、病気の人との濃厚接触を避けることの重要性が強調されている。

ベッドフォードからの今日のツイートの全シリーズは次のとおりです。