フレッド・ハッチとマイクロソフトが共同設立した研究連合が、初期のがん研究を発表
リサ・スティフラー著
太平洋岸北西部のトップクラスのがん研究グループ間でデータを共有する共同研究で、乳がんのモニタリングのための遺伝子分析、腸内細菌と抗がん剤の相互作用、がんの種類を識別する機械学習に焦点を当てた最初の3つのプロジェクトが発表された。
カスケディア・データ・アライアンスは、がん特有の特性と個々の患者におけるその挙動を解明し、個人差を認識して個別化された治療を行う取り組みに取り組んでいます。これらのプロジェクトには、120万ドル以上の資金と、MicrosoftのAzureクラウドコンピューティングサービスの利用権が付与されます。
このコンソーシアムは、2019年にマイクロソフトとフレッド・ハッチンソンがん研究センターによって「Cascadia Data Discovery Initiative」という名称で設立されました。他のアライアンスメンバーには、BC Cancer、ブリティッシュコロンビア大学、ワシントン大学eScience Institute、オレゴン健康科学大学（OHSU）のナイトがん研究所が含まれます。
この取り組みは、マイクロソフトのより広範な AI for Good プログラムの一部である AI for Health イニシアチブの範囲内にあります。
これらは最初の 3 つのプロジェクトです。
乳がんモニタリングのための遺伝子解析
乳がん治療中、腫瘍細胞の塊は時間の経過とともに変異し、薬剤耐性を獲得する可能性があります。このプロジェクトでは、これらの変化をより詳細に特徴づけ、モニタリングするために、2つの最先端技術を活用します。1つは、個々の細胞について詳細な情報を提供する単一細胞ゲノムシーケンシング、もう1つは、血液検査を用いてがんを検出・研究するリキッドバイオプシーです。
このパイロットプロジェクトには、フレッド・ハッチ、BC がん研究所、ワシントン大学の研究者が参加しています。
腸内細菌と抗がん剤の相互作用
研究者たちは、患者の免疫システムを利用して腫瘍と闘う抗がん剤が、腸内細菌の影響を受けることを知っています。しかし、どの細菌種が薬剤の効果に最も大きな影響を与え、治療に副作用を引き起こすのかは分かっていません。
フレッド・ハッチ・センター、ブリティッシュコロンビア州がんセンター、オハイオ州立大学（OHSU）の科学者たちは、患者の口腔組織と便のサンプルを収集し、リポジトリを構築しています。ゲノム技術、データ分析、クラウドコンピューティングを駆使して細菌を特定し、患者の転帰との相関関係を明らかにする予定です。
がんの種類を識別するための機械学習
例えば、卵巣がんはすべて同じではなく、特定の種類のがんがあり、それらに対しては標的治療が用いられます。病理医はがん細胞を視覚的に検査し、どの種類のがんが存在するかを診断し、その結果に基づいて治療法を決定します。
フレッド・ハッチ病院、BCがんセンター、オハイオ州立大学（OHSU）、ブリティッシュコロンビア大学（UBC）のチームが、機械学習を用いてがんサンプルを分析し、がんの特定を行う国際ネットワークの構築に取り組んでいます。このプロジェクトでは、卵巣がんをテストケースとして用います。研究者たちは、診断精度の向上に加え、患者のプライバシーとデータセキュリティを確保するプラットフォームの構築にも取り組んでいます。
世界中の医療提供者が使用できる、この種の機械学習診断ネットワークのモデルを作成することが期待されています。
