ヒューレット・パッカード・エンタープライズがスーパーコンピュータ脳シミュレーションのサポートに選定
アラン・ボイル著
ヒューレット・パッカード・エンタープライズは、マウスの脳の内部の仕組みをシミュレートするように設計されたスーパーコンピュータを2020年までに構築するために選ばれたと発表した。
「ブルー・ブレイン5」と呼ばれるこのコンピュータは、スイス主導の哺乳類の脳のモデル化とシミュレーションを行う「ブルー・ブレイン・プロジェクト」のプラットフォームとなる。ローザンヌ連邦工科大学ローザンヌ校（EPFL）の監督下にあるこのプロジェクトは、欧州の「ヒューマン・ブレイン・プロジェクト」や米国の「ブレイン・イニシアチブ」といった国際的な神経科学研究の取り組みと連携している。
「ブルー・ブレイン・プロジェクトの科学的使命は、当社のスーパーコンピューティング能力に大きく依存しています」と、プロジェクト共同ディレクターのフェリックス・シュールマン氏は本日、ヒューレット・パッカード・エンタープライズとの協力を発表するニュースリリースで述べた。
「現在、Blue Brainで個々のニューロンをモデル化すると、約2万個の常微分方程式が必要になります。脳の領域全体をモデル化すると、この数は瞬く間に1000億個にまで膨れ上がり、同時に解く必要が生じます」とシュールマン氏は述べた。「HPEは、スーパーコンピューティングにおける困難な技術環境を乗り越える上で、私たちを支えてくれます。」
HPE は 2017 年末にこのプロジェクトの最初の契約を獲得しており、その後の作業により契約総額は 1,800 万ドルを超える可能性があります。
このスーパーコンピュータは、HPE SGI 8600 システムをベースとしており、視床と大脳新皮質に重点を置き、マウスの脳の全領域をモデル化する目的でカスタマイズされています。
https://www.youtube.com/watch?v=3Fmsq_Qg7Nw
マウスの脳の働きをより深く理解することで、人間の脳のより複雑な働きについてのヒントが得られ、病気がどのように神経機能を妨げるかが明らかになるはずです。
HPEの社長兼CEOであるアントニオ・ネリは次のように述べています。「私たちの使命は、医療業界が標的治療を提供し、命を救うためのテクノロジーを支えることを含め、生活の質を向上させるテクノロジーを創造することです。Blue Brain Projectとの連携を通じて、HPEは高度なスーパーコンピューティングとカスタムアプリケーションを提供し、神経科学コミュニティと社会全体に変革をもたらす新たな研究を推進していきます。」
Blue Brain Project の HPE SGI 8600 スーパーコンピューターは 372 個のコンピューティング ノードを活用し、1.06 ペタフロップスのピーク性能を実現します。
続きを読む:アレン・ブレイン・インスティテュートがコンピューター化されたニューロンのデータベースを公開
HPEによれば、このシステムは94テラバイトのメモリ（ノートパソコン23,000台分のメモリに相当）を搭載し、Intel Xeon Gold 6140およびIntel Xeon Phi 7230プロセッサ、NVIDIA Tesla V100グラフィックプロセッサを搭載しているという。
もう少しマニアックな話になりますが、このシステムはシングルレールおよびデュアルレールのMellanox InfiniBand高性能ネットワークを使用し、DataDirect Networks製の4ペタバイトの高性能ストレージを搭載しています。この構成では、80GB/秒のInfinite Memory Engineフラッシュベースバーストバッファと連携し、50GB/秒以上の集約帯域幅を実現します。
ルガーノのスイス国立スーパーコンピューティングセンターに設置されたこの設備には、熱せられた空気をデータセンターに送り込まないエネルギー効率の高い液体冷却システムが組み込まれている。
その他のニュースとしては、米国エネルギー省がIBM社製で開発したスーパーコンピュータ「Summit」が、ベンチマークである「High Performance Linpack」（HPL）で122.3ペタフロップスの処理速度を記録し、世界トップ500スーパーコンピュータランキングで首位を獲得しました。Summitは先月発表されました。
中国のSunway TaihuLightは、HPL性能93ペタフロップスで2年間トップに君臨した後、2位に後退した。エネルギー省のSierraスーパーコンピュータは71.6ペタフロップスで3位につけている。
