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アレン研究所はマウスの脳細胞データベースのサイズを 3D でほぼ 2 倍に拡大しました。

アレン研究所はマウスの脳細胞データベースのサイズを 3D でほぼ 2 倍に拡大しました。

アラン・ボイル

アレン・ブレイン・エクスプローラー
Allen Brain Explorerは、仮想マウスの脳を3Dで表示できます。(アレン脳科学研究所)

アレン脳科学研究所は、アレン細胞タイプデータベースに約 900 個の仮想マウス脳細胞を追加し、研究に利用可能な細胞の総数は 1,900 個をわずかに上回るようになりました。

しかし、待ってください。まだあります。

本日のリリースには、Allen Brain Explorerと呼ばれる3Dビューアのブラウザベースの新しいベータ版も含まれています。このビューアでは、マウスの脳の解剖学的構造と接続マップを探索できます。Allen Mouse Brain Connectivity Atlasは、より多くの情報を追加して刷新されました。マウス、ヒト、マカクの脳細胞におけるRNA転写に関する詳細情報も追加されています。

これらのアップグレードはすべて、マイクロソフトの共同創業者であるポール・アレン氏が2003年に創設し、5億ドルもの資金援助を行っているアレン研究所のオープンサイエンスミッションの一環である。

より大きなデータセットは、神経科学者に細胞の複雑性に関するより豊富な説明を提供し、脳細胞の種類の「周期表」を具体化することを可能にするはずです。

「私たちは細胞の様々な側面、つまり遺伝子活性、形状、情報伝達先、電気的挙動などを用いて、生物学的意味を持つ分類を行っています」と、アレン脳科学研究所の技術担当副所長であるデビッド・フェン氏は本日のニュースリリースで述べた。「脳内の細胞の特性を理解することは、脳の働きを理解するための重要な一歩です。」

新たに公開されたヒトおよびマカクの脳に関する単一細胞データセットは、ワシントン大学医学部とスウェーデン神経科学研究所のチームとの共同研究によって作成されました。このデータは、研究者がヒトの脳と動物モデルの脳の違いをより深く理解するのに役立つと期待されます。

「脳に影響を与える病気は、脳の特定の部位、あるいは特定の細胞種から始まる可能性があります」と、 アレン脳科学研究所の分子遺伝学准所長、ボシリカ・タシック氏は述べています。「病気がどこで始まるのか、そして最終的にどのように治療するのかを知るためには、脳を構成する個々の要素を理解する必要があります。」

同研究所は、Allen Brain Explorerの新バージョンに加えて、遺伝子の類似性パターンに基づいて脳細胞のカテゴリーを視覚化できるRNA-Seq Data Navigatorのベータ版もリリースする予定だ。

脳研究所のすべてのオンライン リソースと同様に、データと分析ツールは世界中の研究者が無料で自由に利用できます。