国防総省、COVID-19変異株に対する新たな抗体発見を支援するシアトルのスタートアップ企業に110万ドルを支給
シャーロット・シューベルト著
シアトルに拠点を置くA-Alpha Bio社は、ローレンス・リバモア国立研究所と共同で、COVID-19の変異株に対する新たな治療法の研究を支援します。このパートナーシップは、米国国防総省から同社に授与された110万ドルの下請け契約に基づいています。
ソトロビマブなどのモノクローナル抗体療法は、COVID-19に対する重要な対策です。しかし、すべての抗体がすべての変異株に有効というわけではなく、研究者たちは新たな治療法の探索に取り組んでいます。A-Alpha Bioの技術は、機械学習を活用した体系的なアプローチで、新たな抗体を発見するものです。
A-Alpha BioのAlphaSeqプラットフォームは、酵母によって発現される様々なタンパク質の相互作用を検出し、計算的に解析することができます。同社のアプローチは、抗体とウイルスタンパク質の間など、数百万ものタンパク質間相互作用を測定することができます。
この新たなプロジェクトでは、研究者らは抗体とコロナウイルス変異株のパネルとの相互作用を評価する。得られたデータは、どの抗体配列が現在の変異株や将来出現する可能性のある変異株に強く結合する可能性が高いかを予測するためのモデルを改良するために用いられる。このような高親和性抗体は、強力な治療薬となる可能性を秘めている。
「私たちは、AlphaSeqを活用したML（機械学習）モデルの構築に協力し、新たなウイルス変異体に対する治療法の発見と最適化を加速することを楽しみにしています」と、A-Alpha Bioの共同創業者兼CEOであるDavid Younger氏は、この提携を発表する声明の中で述べた。
ヤンガー氏は2017年、CTOのランドルフ・ロペス氏と共に、ワシントン大学タンパク質設計研究所の大学院研究員時代に開発に携わった技術を用いて同社を設立しました。昨年9月には2,000万ドルの新たな資金調達を発表し、12月にはカイメラ・セラピューティクス社との「分子接着剤」開発に関する提携を発表しました。
A-Alpha Bioチームは、ローレンス・リバモア大学でAIを活用した生物学的対抗手段の開発を担当する主任研究者であるダニエル・ファイソル氏と協力します。この共同研究は、ワクチン設計に関する知見をもたらす可能性も秘めています。
この発表は、シアトル地域の研究者による、COVID-19の新たな診断法、ワクチン、治療薬の開発を支援するための複数のプログラムに基づいています。
例えば、シアトルに拠点を置くHDTバイオは、次世代COVID-19ワクチン開発の取り組みを主導しており、1月にブラジルで第1相臨床試験で最初の患者に投与しました。HDTバイオのRNAベースのワクチンは製造の容易さを重視して設計されており、インドで第2相および第3相臨床試験に移行しています。
2月、ワシントン州ボセルに拠点を置くAGCバイオロジクスは、ファイザー・ビオンテック向けにオミクロンベースのCOVID-19ワクチンの製造に必要な主要原料を提供すると発表しました。AGCは、RNAベースのワクチンの鋳型として使用されるDNAを、ドイツのハイデルベルクにある自社施設から供給します。
