COVID-19の新しいダッシュボードは、変異株に対する診断検査の有効性に関するデータを共有します
リサ・スティフラー著
COVID-19ワクチンに注目が集まる中、より危険なウイルスの変異株がますます優勢になりつつある。
ワシントン州では、英国型変異株（B.1.1.7）と、カリフォルニア州で最初に確認された2つの近縁変異株が、他の株を急速に追い抜いています。州は各変異株の相対的な割合を大まかに推定しているに過ぎませんが、英国型とカリフォルニア州型はそれぞれ感染者の約3分の1を占めています。残りの3分の1は、元のウイルスとその他の変異株です。他の州でも同様の傾向が見られます。
感染者数が増えるにつれ、国際保健非営利団体PATHは、最も懸念される変異株の検出を逃れないようにする取り組みに役立っている。
シアトルを拠点とするPATHは最近、COVID-19検査が感染者の変異株に関わらず感染を特定する能力に関する情報をまとめたツールを公開しました。PATHの研究者たちは、数十社ものメーカーから数百種類の検査データを手作業で収集し、利用可能な診断ツールの評価を容易にしています。しかし、ほとんどの検査については、変異株に対する性能に関する情報は非常に限られています。
この変異株に焦点を当てたデータベースは、データ可視化企業Tableauの支援を受けてPATHが開発した、より広範なCOVID診断プラットフォームの一部です。検査の性能、製造場所と使用承認場所、そして市販の有無に関する情報が含まれています。
世界中で健康の公平性の問題に取り組む組織であるPATHは、主に政府や政策立案者、特に低所得国の人々が使用するためにこのプラットフォームを開発しました。
米国では、国内の感染率とワクチン接種率に注目が集まっていますが、保健専門家はCOVID-19が世界的な懸念事項であることを改めて強調しています。最初のウイルスと、最も問題となっている変異株の多くは、米国外で発生しました。自国の住民と世界的なCOVID-19の蔓延を抑えるためにも、他国がウイルスを追跡し、予防対策を講じることは極めて重要です。
「COVID-19は消え去ることはありません。インフルエンザのような風土病ウイルスになる可能性が非常に高いです」と、PATHの診断科学プログラムオフィサーであるロレイン・リリス氏は述べた。「そのため、継続的なモニタリング、診断、そして現状把握のための診断技術が必要になるでしょう。」
PATHの研究者たちは、自分たちの研究が、あまり知られていない小規模の診断機器メーカーに光を当てて市場に多様性をもたらし、検査メーカーが変異株に対する性能データを共有するよう促すきっかけになることを期待している。
COVID-19の検査には2つの方法がある。妊娠検査のようにウイルスの断片を探す迅速抗原検査と、PCR（ポリメラーゼ連鎖反応）を使ってウイルスの遺伝物質を微量でも検出する分子検査だ。
3月末までに、米国食品医薬品局（FDA）は、懸念される変異株の一部に見られる変異によって「性能が影響を受ける可能性がある」4つの分子検査を特定しました。これらの検査は、この種の問題を防ぐために複数の標的を含んでいるため、陽性反応を検出することは可能です。しかし、利用可能な検査が数多くあり、さらに新たな検査が市場に投入されているため、どれが最も効果的かを判断するのは困難です。
「この点については、とにかく混乱が多すぎます」と、PATHの診断担当副ディレクター、ネハ・アガルワル氏は述べた。「データアグリゲーターが構築されているのを見たことがなく、そのギャップを埋める必要性を感じたのです。」
研究者らは診断検査に加え、陽性COVIDサンプルのサブセットを採取し、ウイルスの遺伝子コード全体を配列決定し、どの変異体が存在するかを特定し、新たな変異を特定している。
ワシントン州はシーケンシングの分野で先駆的な存在であり、3月のCOVID陽性検体の約11%を精査しました。シーケンシングに選ばれた検体は州内の変異株の分布を完全に反映しているわけではありませんが、それでも変異株が時間とともに拡大していることは容易に分かります。例えば、B.1.1.7変異株は、2月上旬から中旬にかけて採取された検体ではわずか3.5%にしか見られませんでした。しかし、3月下旬には、シーケンシングされた感染者の35.5%を占めるまでになりました。
元のCOVIDウイルスと比較して、B.1.1.7は約50%伝染力が強く、より重篤な感染症を引き起こす可能性が高くなります。初期の研究では、ワクチンは依然として有効であることが示唆されています。
「これまでの検査は変異株の懸念には対応していますが、依然として警戒が必要です」とリリス氏は述べた。「これらのウイルスは非常に簡単に変異する可能性があります。検査を開発する際には、できるだけ多くの変異株を検出できるようにする必要があります。」
