AIは医薬品の発見と開発を促進しているが、独自のデータに関する疑問も生じている。

太平洋岸北西部のコラボレーション文化、バイオ医薬品に対する AI の影響、AI によって推進される新しいビジネスモデルの形態など、水曜日にシアトルで開催された 2024 Life Science Innovation Northwest 会議のパネルディスカッションで取り上げられました。

「太平洋岸北西部にはコンピューターやバイオテクノロジーがあるが、国内の他の地域には見られないような協力や共有の文化もある」とワシントン大学タンパク質設計研究所（IPD）のリンダ・スチュアート所長は語る。

「地域ハブが出現するのはごく自然なことだ」と、オレゴン州ポートランドに拠点を置き、AIを活用した医薬品設計に多額の投資を行っているNVIDIAの応用研究担当副社長、ジョナサン・コーエン氏は語った。

このハブの中心に位置するのがIPDです。IPDは、タンパク質ベースの治療薬、ワクチン、材料、バイオセンサーを開発するためのオープンソースAIツールを開発しており、シアトル地域のスピンアウト企業や関連企業は相互に連携し、大手バイオ医薬品企業と提携しています。

マイクロソフトは9月にタンパク質を生成するオープンソースモデルを発表し、他の大手テクノロジー企業もこの分野に参入している。

スチュアート氏によると、主要な目標の一つは、新たな治療用タンパク質を発見するだけでなく、「品質設計」を通じて臨床開発期間を短縮することだという。研究者は、製造の容易さや他の分子との望ましくない交差反応性といった特性についてタンパク質を評価できるようになったという。

バイオ医薬品におけるAIの活用は、タンパク質設計だけにとどまりません。シアトル地域に1,500人以上の従業員を擁するブリストル・マイヤーズ スクイブ社は、臨床試験に適した患者をマッチングさせるために、社内データをマイニングするために機械学習を活用していると、同社のトランスレーショナル・インフォマティクスおよび予測科学担当サイエンティフィック・エグゼクティブ・ディレクター、ダニエル・グリーンウォルト氏は述べています。

BMSは現在、「仮想」臨床試験を実施できるようになり、ChatGPTのようなモデルを使用してプロトコルと同意書を簡素化しているとグリーンウォルト氏は述べた。

ワシントン州バンクーバーに拠点を置くバイオテクノロジー企業、アブサイ社のショーン・マクレインCEOは、新しいAIツールにより、企業はより迅速かつ低コストで医薬品を臨床に投入できるようになると述べた。同社は、IPDからのスピンアウトではないこの分野では数少ない地域企業の一つだ。

将来的には、研究者はコンピューターで設計された治療薬の生物学的特性を予測する能力を高めるだろうとマクレイン氏は付け加えた。

マクレイン氏は、最近の進歩の多くはワシントン州の研究に端を発していると述べ、「ここでは本当に特別な環境が生まれている」と語った。

パネリストたちは、生物学的データの生成、標準化、そして収集という新たな方法がAIモデルの強化にどのように役立つかについても議論しました。グリーンウォルト氏によると、製薬会社は特定の疾患をめぐる「競争前段階」のコンソーシアムに投資し、互いのデータやモデルから学び合っているとのことです。データやリソースを共有するための他の取り組みとしては、シアトルを拠点とするコンソーシアム「OpenFold」などが挙げられます。

それでも、「生物学では、世界中の高品質なデータの多くが独自のデータベースに閉じ込められているのが現状です」とコーエン氏は語った。

最終的には、独自のデータが、ますます多くのオープンソース AI モデルを活用する企業にとっての差別化要因になる可能性があるとパネリストらは述べた。  

コーエン氏は、企業が独自のデータ、微調整、そして社内の専門知識をオープンソースのプラットフォームツールに組み込むビジネスモデルを構想しています。彼はNVIDIA独自のチップ設計プロセスを例に挙げました。同社は、NVIDIAの社内ドキュメントとコードを用いてオープンソースの大規模言語モデルを学習させ、同社独自のAI搭載チップ設計システムを構築しました。

「こうした共有コミュニティ基盤モデルの創出は、まさにプラットフォームとなり、誰もがその上でそれぞれの活動を展開できるようになります」とコーエン氏は述べた。「そして、ライフサイエンス分野でも、経済的に非常に理にかなっているという非常に説得力のある議論があると思います。」

IPDが構築したようなプラットフォームモデルが、公的資金で運営されている大学から生まれることが重要だとスチュアート氏は述べた。「これはこの地域、そして世界にとって、他に類を見ない資産です」とスチュアート氏は述べた。

研究者、研究機関、そして企業は、データを保持することと、データを共有することで「すべての船を浮かせる」こととのバランスをまだ模索しているとスチュアート氏は述べた。それがどのように展開するかは、新しい企業の設立方法に影響を与えると彼女は述べた。データは、新しい企業が生まれるためのコモディティになるかもしれないのだ。

「これはコミュニティとエコシステムにとっての問題です。私たちの人々は、自分たちの基盤モデルについてどれだけ独占的になるのか、そしてどれだけを共有するだけなのか」とスチュアート氏は語った。